Предусматривают создание неблагоприятных экологических условий для клещей в местах их обитания, их уничтожение и предотвращение укусов. Личная профилактика сводится к защите от нападения клещей использованием специальной одежды и репеллентов. Существенного снижения численности клещей можно достигнуть обработкой домашнего скота пестицидами, предусмотренными ветеринарно-зоотехнической службой.

Эффективным методом ограничения численности клещей могут служить лесомелиоративные мероприятия, включающие расчистку и благоустройство лесов: - удаление сухостоя и валежника; - проведение санитарных рубок леса; - скашивание трав;- разрежение кустарника.

В зонах отдыха и местах расположения оздоровительных учреждений такие лесотехнические мероприятия обязательны. Дератизационные мероприятия направлены на уменьшение численности прокормителей клещей (диких грызунов) и проводятся на расчищенных территориях осенью и весной. Обязательные составные части комплексного плана противоклещевых мероприятий в очагах: - гигиеническое воспитание; - внедрение средств защиты среди населения.

Специфическую профилактику проводят инактивированной культуральной вакциной. Она включает троекратную вакцинацию и последующую ревакцинацию через 4, 6 и 12 мес. Вакцинируют лиц, проживающих на эндемичных по клещевому энцефалиту территориях (привитость должна быть не менее 95%) и выезжающих в очаги. Ежегодно в стране вакцинируют от 650 000 до 900 000 и более, а ревакцинируют - от 1,32 до 1,52 млн человек. В 2007 г. вакцинировано 914 376 человек, что на 14% больше, чем в 2006 г. (786 551 человек), ревакцинировано 1 524 408 человек, что на 6% больше, чем в 2006 г. (1 426 269 человек).