В соответствии с Конституцией предложения о структуре федеральных органов исполнительной власти представляются Президентом Председателем правительства не позднее недельного срока со дня его назначения. Структура утверждается Президентом РФ. Правительство обеспечивает единство системы исполнительной власти, направляет и контролирует деятельность ее органов. В систему федеральных органов исполнительной власти входят: министерства, государственные комитеты, федеральные комиссии, федеральные службы, российские агентства, федеральные надзоры, иные федеральные органы.

Создание федеральных органов исполнительной власти, их реорганизация и ликвидация осуществляется Президентом РФ по предложению Председателя правительства РФ.

В соответствии с ФКЗ «О Правительстве РФ» Президент РФ руководит деятельностью федеральных органов исполнительной власти, ведающих вопросами обороны, безопасности, внутренних дел, иностранных дел, предотвращения чрезвычайных ситуаций и ликвидации стихийных бедствий, утверждает по представлению Председателя правительства положения о них и назначает руководителей.

Координацию деятельности иных органов осуществляет Правительство РФ. Предельная численность и фонд оплаты труда работников центральных аппаратов федеральных органов исполнительной власти , деятельностью которых руководит Президент, и их территориальных органов утверждается Президентом РФ по представлению Председателя Правительства.

Предельная численность и фонд оплаты труда работников центральных аппаратов федеральных органов исполнительной власти, деятельностью которых руководит Правительство , и их территориальных органов утверждается Правительством РФ.

В систему федеральных органов исполнительной власти входят также их территориальные органы.